Dalam satuan keamanan desa, tingkatan ninja menandakan tingkatan-tingkatan yang di bagi berdasarkan kemampuan seorang ninja dalam melalui ujian yang diberikan para petinggi desa. Penduduk yang tinggal di desa Panjang Umur, harus
melewati beberapa ujian sebelum ia bisa disebut ninja, dan mendapatkan
tingkatan sesuai dengan kemampuannya. Tidak semua ninja ditingkatan yang
sama memiliki kemampuan yang sama, begitu juga seorang ninja dengan
tingkatan rendah mungkin memiliki kemampuan yang lebih besar daripada
ninja di tingkatan atasnya.
Sebagai tambahan, terdapat beberapa tingkatan jabatan atau gelar
khusus yang dapat diterima seorang ninja. Jabatan dan gelar ini berbeda
dengan tingkatan normal, seorang ninja mungkin memiliki gelar yang sama
dengan seorang yang tingkatan normalnya lebih tinggi atau lebih rendah
daripada ninja tersebut.
NUKENIN
Nukenin adalah para shinobi yang lari dan mengkhianati desanya. Seorang
ninja seumur hidupnya harus tinggal di desa mereka dan keluar hanya
untuk menjalankan misi. Para nukenin ini ada yang berkelompok ada pula
yang personal. Para nukenin ini kebanyakan adalah kriminal di desa asal
mereka. Ada pula nukenin yang masuk ke desa lain dan menjadi anggota
desa tersebut.Contohnya adalah Sasuke.
OININ
Oinin adalah ninja pengejar yang misinya adalah mengejar dan
menghancurkan target. Tidak selamanya mereka harus mengejar kriminal
atau nukenin. Ada pula ninja biasa yang ditugasi mengejar sekelompok
ninja lain yang melarikan diri dari pertempuran. Seperti tim Shikamaru
yang ditugasi untuk mengejar Sasuke. Atau ketika dia mengejar Hidan dan Kakuzu.
Contoh dari oinin di antara lain yaitu adalah Naruto,Kiba,Neji,Chouji
dan Shikamaru saat mengejar Sasuke yang ingin pergi kepada Orochimaru.
KELAS " S "
Shinobi kelas S adalah shinobi dengan tingkat kekuatan tertinggi dalam dunia ninja. Mereka sangat kuat dan beberapa di antaranya adalah kage
dari desa-desa tersembunyi. Hampir semua ninja lebih memilih menghindar
daripada menghadapi ninja kelas S. Banyak dari ninja kelas S adalah
ninja pelarian dan kriminal. Para Sannin adalah ninja dalam golongan
ini. Semua anggota Akatsuki juga golongan ninja ini.
SANIN
Sannin berarti 3 ninja. Legendary Sanin adalah julukan yang diberikan
Hanzou kepada Jiraiya, Tsunade, dan Orochimaru pada saat akhir
peperangan antara negeri api dan negeri hujan. Hanzou sangat terkesan
dengan kemampuan mereka bertiga karena dapat bertahan dalam perang
tersebut. Dan akhirnya ketiga ninja yang dulunya sahabat itu dikenal
sebagai Legendary Sannin. Kekuatan mereka yang tersohor dan sekelas Kage membuat kawan maupun lawan hormat pada mereka.
KAGE
Hokage, Mizukage, Kazekage, Raikage, Tsuchikage adalah ninja tertinggi
yang memimpin suatu desa tersembunyi. Biasanya mereka memiliki kemampuan
diatas rata-rata dan cukup disegani. Sejauh ini Hokage Mizukage Raikage
Tsuchikage Kazekage sudah ditunjukkan rupanya. Gelar kage hanya
diberikan pada pemimpin 5 desa tersembunyi negara besar ninja saja.